Réunion


Journées Imagerie Optique Non Conventionnelle - 15ième édition

Date : 11 Mars 2020
Horaire : 09h00 - 17h00
Lieu : Institut Langevin, 1 rue Jussieu, Paris 5e
Axes scientifiques :
  • Audio, Vision et Perception
GdRs impliqués :
Organisateurs :

Nous vous rappelons que, afin de garantir l'accès de tous les inscrits aux salles de réunion, l'inscription aux réunions est gratuite mais obligatoire.

Inscriptions

0 personnes membres du GdR IASIS, et 0 personnes non membres du GdR, sont inscrits à cette réunion.

Capacité de la salle : 150 personnes. 150 Places restantes

Annonce

La 15ième édition des « Journées Imagerie Optique Non-Conventionnelle » (JIONC) se tiendra dans les locaux de l’Institut Langevin, Paris 5e, les 11 et 12 mars 2020.

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Dernière minute: Tentative de vidéoconférence des JIONC (en complément du présentiel)

En raison des confinements imposés, et des contraintes de plusieurs participants prévus qui ont dû annuler leur venue en raison de la propagation de l’épidémie de Coronavirus, nous tenterons de mettre en place une diffusion live des JIONC sur l’outil Renater « Rendez-vous ».

– La conférence sera accessible sur un navigateur internet simple
sans nécessiter d’installation de soft particulier.

– LE LIEN DE LA WEBCONFÉRENCE SERA COMMUNIQUÉ PAR MAIL SUR LA
MAILING-LIST DES JIONC ET DES INSCRITS À CHAQUE DÉBUT DE SESSION (POTENTIELLEMENT DIFFÉRENT APRÈS CHAQUE INTERRUPTION)

– Nous tenterons de diffuser les Slides de présentation sur un
premier canal: SLIDES JIONC2020

– Nous tenterons de diffuser une vue Webcam simultanée de
l’orateur et de l’écran sur un second canal: AMPHI JIONC 2020

– Nous tenterons de maintenir une écoute sur l’outil de « Chat »
afin de pouvoir relayer d’éventuelles questions distantes aux
orateurs.

– Pour un fonctionnement optimal, nous vous demandons de couper les
flux vidéo et audio (webcam et micro coupés) sortants depuis les
sites distants.

Il s’agit d’une solution de dernière minute, au résultat non
garanti étant donné les multiples contraintes (accès wifi, flux
renater, disponibilité des organisateurs, impossibilité de tester
avant demain matin…).

NOUS COMPTONS SUR VOTRE INDULGENCE SI CETTE SOLUTION NE PARVENAIT
PAS À DIFFUSER AVEC SUCCÈS LES JIONC À DISTANCE.

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À l’interface de l’optique et du traitement du signal/image, ces rencontres visent à réunir les acteurs nationaux (chercheurs, ingénieurs, académiques ou industriels) de ces différents domaines, afin d’échanger sur les plus récents développements de systèmes ou de traitements pour l’imagerie non-conventionnelle et d’évaluer leurs applications potentielles.

Nous proposons, cette année, une matinée de session spéciale sur le thème de « l’imagerie d’objets non résolus ».

Présentation de la session spéciale :

L’imagerie d’objets non résolus recouvre un large panel de techniques expérimentales exploitées en biologie, chimie moléculaire (PALM-STORM), médecine (ULM) ou en mécanique des fluides (PIV). La phénoménologie commune des images (superpositions de motifs élémentaires d’objets indiscernables) explique les similarités méthodologiques des traitements mis en oeuvre (variantes de l’algorithme CLEAN, approches parcimonieuses, …) dans ces différents domaines applicatifs. L’objet de cette session spéciale est de réunir les acteurs de contributions méthodologiques (conception de systèmes d’imagerie, méthodes de reconstruction) pour échanger sur les problématiques et avancées d’intérêt commun.

Les contributions attendues sont de nature applicatives ou méthodologiques au sens large (algorithmes de calibrage, de traitement d’image, évaluation de performance par benchmarking, et la co-conception instrument/traitement d’image)

Cette session proposée et animée par F. Champagnat (ONERA-DTIS) et C. Soussen (L2S, CentraleSupélec) commencera par une conférence invitéede Daniel Sage (EPFL, Lausanne, Suisse) intitulée « Computational imaging: the quest of super-resolution in 3D fluorescence microscopy ». Elle sera suivie de communications issues des contributions reçues pour cette session spéciale.

L’autre présentation invitée sera donnée par Virginie Chamard (Institut Fresnel, CNRS, Univ Aix-Marseille) sur la ptychographie rayons X pour l’imagerie 3D des biomatériaux.

Naturellement, comme chaque année, nous sollicitons également des propositions de communications de nature théorique et applicative, sur les thèmes suivants (liste non exhaustive) :

  • Modalités d’imagerie non conventionnelles
  • Conception d’imageurs innovants
  • Méthodes de traitement en imagerie non conventionnelle
  • Approches « problèmes inverses » pour l’imagerie
  • Imagerie biomédicale
  • Applications de ces systèmes d’imagerie

Comité d’organisation :

Julien Fade, Institut FOTON, tel: 02 23 23 52 15, julien.fade@univ-rennes1.fr

Corinne Fournier, Laboratoire Hubert Curien, tel: 04 69 66 32 61, corinne.fournier@univ-st-etienne.fr

Matthieu Boffety, Institut d’Optique – Lab. C. Fabry, tel: 01 64 53 32 98, matthieu.boffety@institutoptique.fr

Programme

Mise à jour au 11 mars, 8h

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Mercredi 11 mars



9H30-10H00 : ACCUEIL + INTRODUCTION DES JIONC 2020


10H00-10H50 : CONFÉRENCE INVITÉE


« Achieving higher resolution in 3D fluorescence imaging: deconvolution microscopy and single-molecule localization microscopy »

Daniel Sage

Biomedical Imaging Group (BIG), École Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), Lausanne,Suisse

? Résumé en fin de programme



10H50-11H30 : SESSION SPECIALE « IMAGERIE D?OBJETS NON RESOLUS » - PARTIE I : IMAGERIE DE PARTICULES


« ExPACO: détection de motifs spatialement étendus dans des images présentant un bruit non stationnaire corrélé »

Olivier Flasseur1,2, Loïc Denis1, Eric Thiébaut2, Thomas Olivier1, Corinne Fournier1

1Univ Lyon, UJM¬ Saint ¬Etienne, CNRS, Institut d?Optique Graduate School, Laboratoire Hubert Curien UMR 5516, Saint ¬Etienne, France

2Univ Lyon, Univ Lyon1, ENS de Lyon, CNRS, Centre de Recherche Astrophysique de Lyon UMR 5574, Saint¬Genis¬ Laval, France


« Problème inverse appliqué à la détection de particules pour la PIV »

Adam Cheminet1, Jean-François Krawczynski2, Philippe Druault2

1Université Paris-Saclay, CEA, CNRS, SPEC, Gif-sur-Yvette, France

2Sorbonne Université, CNRS, Institut Jean Le Rond d?Alembert, Paris, France


« Lagrangian Particle Image Velocimetry » [ANNULE]

Yin Yang1 , Dominique Heitz1,2, Etienne Mémin1,2

1INRAE, UR OPAALE, Rennes, France

2INRIA, Équipe Fluminance, Rennes, France


« Imagerie interférométrique de particules rugueuses irrégulières » [ANNULE]

Marc Brunel1 , Mohamed Talbi1, Barbara Delestre1, Michael fromager2

1UMR CNRS 6614 CORIA, Université de Rouen Normandie, Saint-Etienne du Rouvray, France

2UMR CNRS 6252 CIMAP, CEA, Ensicaen, Université de Caen, France


11H30-12H10 : SESSION SPECIALE « IMAGERIE D?OBJETS NON RESOLUS » - PARTIE II : SUPER-RESOLUTION


« Volumetric compressive fluorescence nanoscopy »

Payvand Arjmand1, Marco Pascucci2, Aditya Tripathi3, Ori Katz3, Valentina Emiliani2,4, Marc Guillon1,2

1Saints-Pères Paris Institute for Neurosciences UMR 8003, Université de Paris, Paris

2Neurophotonics Laboratory, CNRS UMR 8250, Université Paris Descartes, Paris

3Department of Applied Physics, The Hebrew University of Jerusalem, Israel

4Institut de la Vision, Sorbonne Université, Inserm S968, CNRS UMR7210, Paris, France


« Co-conception en imagerie PALM : comment imager dans les milieux épais ? »

Olivier Lévêque, Caroline Kulcsar, François Goudail

Université Paris-Saclay, Institut d?Optique Graduate School, CNRS, Laboratoire Charles Fabry, Palaiseau, France.


12H10-14H00 : DEJEUNER


14H00-15H00 : SESSION SPECIALE « IMAGERIE D?OBJETS NON RESOLUS » - PARTIE II : SUPER-RESOLUTION? SUITE


« Super-resolution approaches in photoacoustic imaging »

Bastien Arnal, Sergey Vilov, Guillaume Godefroy, Emmanuel Bossy

LiPhy, UGA, CNRS, Grenoble cedex 9, France


« Dépasser la limite de diffraction des imageurs passifs conventionnels ? »

Nicolas Ducros1, Aurélien Bourquard2,3

1Univ Lyon, INSA-Lyon, UCB Lyon 1, CNRS, Inserm, CREATIS UMR 5220, U1206, Villeubanne

2Research Laboratory of Electronics, Massachusetts Institute of Technology Cambridge, USA

3Biomedical Image Technologies, Universidad Politécnica de Madrid and CIBER-BBN, Madrid, Spain


« Quelle est la taille d?une figure de diffraction ? Estimation du champ de vue et de la résolution en holographie sans lentille »

Ferréol Soulez

Univ. Lyon, ENS de Lyon, CNRS, Centre de Recherche Astrophysique de Lyon UMR5574, Saint-Genis-Laval, France



15H00-16H00 : IMAGE & SON


« Fourier-Transform Acousto-Optic imaging »

Maïmouna Bocoum1, Jean-Luc Gennisson2, Jean-Pierre Huignard1, Anne Louchet-Chauvet1, François

Ramaz1, Jean-Michel Tualle3

1Institut Langevin, Ondes et Images ? ESPCI Paris, PSL Research University, CNRS UMR 7587, Université Paris, Sorbonne, Paris, France

2BIOMAPS, laboratoire d?imagerie biomédicale multi-modale à Paris-Saclay, Université Paris-Saclay, CNRS, INSERM, CEA, Orsay, France

3Laboratoire de Physique des Lasers, CNRS, Université Paris 13, Sorbonne Paris Cité, Villetaneuse, France


« Élastographie quantitative en temps-réel par holographie numérique »

Agathe Marmin1, Stefan Catheline2, Amir Nahas1

1Laboratoire ICube,Université de Strasbourg, Strasbourg, France

2LabTAU, Inserm U1032, Lyon, France


« Imagerie de la diatténuation avec un microscope photoacoustique dans le domaine fréquentiel »

Bathilde Rivière, Olivier Hugon, Eric Lacot, Emmanuel Bossy, Olivier Jacquin

Laboratoire Interdisciplinaire de Physique, St Martin d?Hères, France


16H00-16H30 : PAUSE CAFÉ


16H30-? : SESSION POSTERS

Cf. Liste des posters en fin de programme




?


Jeudi 12 mars



09H00-09H50 : CONFÉRENCE INVITÉE


« X-ray Bragg ptychography: a new approach to help deciphering biomineralization pathways »

Virginie Chamard

Aix-Marseille Université, CNRS, Centrale Marseille, Institut Fresnel UMR 7249, Marseille, France

? Résumé en fin de programme [ANNULE]



09H50-10H50 : IMAGERIE HAUTE ENERGIE


« Application de méthodes de traitement en imagerie X par contraste de phase sur source de laboratoire : détection et correction d?artefacts d?extraction »

Georges Giakoumakis1,2, Jérôme Primot1, Cindy Bellanger1, Julien Jaeck1, Adrien Stolidi2

1ONERA, Palaiseau, France

2CEA, Gif-sur-Yvette Cedex, France


« Un opérateur proximal dédié à la tomographie spectrale, et son application dans une méthode one-step »

Frédéric Jolivet1, Clarisse Fournier1, Jérôme Lesaint2, Michel Garcin1, Andrea Brambilla1

1Univ. Grenoble Alpes, CEA, LETI, Grenoble, France

2CEA, CTREG, DGDO, Bouguenais, France


« Nouvelles possibilités d?imagerie à partir de la Tomographie Compton Circulaire »

Cécilia Tarpau1,2,3, Maï K. Nguyen1

1ETIS, CY Cergy Paris Université, ENSEA, CNRS UMR 8051, Cergy, France

2LPTM, CY Cergy Paris Université, CNRS UMR 8089, Cergy, France

3LMV, Université Versailles Saint Quentin, CNRS UMR 8100, Versailles, France


10H50-11H20 : PAUSE CAFE


11H20-12H20 : TRAITEMENTS POUR LA MICROSCOPIE


« Scans informés pour l'imagerie de tissus biologiques courbes »

Faris Abouakil, Frédéric Galland, Loïc Le Goff

Aix Marseille Univ, CNRS, Centrale Marseille, Institut Fresnel, Marseille, France


« Révéler l?ultrastructure fine du muscle par traitement computationnel d?images générées sans marquage par microscopie multiphotonique »

M. Chalvidal1, C. Lefort2, E. Chouzenoux1, J.-C. Pesquet1, L. Magnol3 et V. Blanquet3

Centre pour la Vision Numérique, CentraleSupélec, Inria Saclay, France

Institut de Recherche XLIM, Université de Limoges, UMR CNRS 7252, Limoges, France

INRAE, Université de Limoges, EA7500, USC1061 GAMAA, Limoges, France


« Machine-learning based bacteria segmentation tool agnostic to imaging modality »

Swapnesh Panigrahi, Tâm Mignot, Leon Espinosa

Laboratoire de Chimie Bactérienne, IMM, Marseille, France




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