Jeudi 17 mars
9H15-9H30 : ACCUEIL + INTRODUCTION DES JIONC 2022
9H30-10H20 : CONFERENCE INVITEE
« Quand la qualité d'image est optimisée par la commande : le cas de l'optique adaptative »
Caroline Kulcsar
IOGS, Université Paris-Saclay - Laboratoire Charles Fabry - CNRS UMR8501, Palaiseau, France.
10H20-11H00 : IMAGERIE A TRAVERS L'ATMOSPHERE - CHAIR : C. KULCSAR
« Restauration d'images corrigées par optique adaptative : approche marginale avec échantillonnage bayésien »
Alix Yan1, Laurent M. Mugnier1, Jean-François Giovannelli2, Romain Fétick1, Cyril Petit1
1 DOTA, ONERA, Université Paris Saclay, Châtillon, France
2 IMS (Univ. Bordeaux, CNRS, BINP), Talence, France
« Imagerie d'ombre de satellites à très haute résolution à travers l'atmosphère par inversion de la diffraction de Fresnel. »
Hanae Labriji, Olivier Herscovici-Schiller, Frédéric Cassaing
DTIS, ONERA, Université Paris Saclay, Palaiseau - France
11H00-11H15 : PAUSE
11H15-12H15 : PROBLEMES INVERSES - CHAIR : F. CHAMPAGNAT
« Reconstructions multisprectrales d'échantillons biologiques avec autocalibration des aberrations chromatiques »
Dylan Brault1, Thomas Olivier1, Ferréol Soulez2, Sophie Dixneuf3, Nicolas Faure4, Corinne Fournier1
1 Univ. Lyon, UJM-Saint-Etienne, IOGS, LaHC UMR CNRS 5516, Saint-Etienne, France
2 Univ. de Lyon1, ENS de Lyon, CRAL, UMR CNRS 5574, Saint-Genis-Laval, France
3 Bioassays, Microsystems & Optical Engineering Unit, BIOASTER, Lyon, France
4 bioMerieux, Centre Christophe Mérieux, Grenoble, France
« Essential pixels for linear unmixing of multichannel biological images »
Raffaele Vitale, Olivier Devos, Michel Sliwa, Cyril Ruckebusch
Dynamics, Nanoscopy and Chemometrics (DyNaChem) Group, Laboratoire Avancé de Spectroscopie pour les Interactions, la Réactivité et l'Environnement (LASIRE CNRS - UMR 8516), Université de Lille, France
« Approche inverse régularisée non supervisée pour la reconstruction 3D en microscopie tomographique diffractive »
Laurence Denneulin1, Fabien Momey1, Dylan Brault1, Matthieu Debailleul2, Asemare Mengistie Taddese2, Nicolas Verrier2, Olivier Haeberlé2
1 Université de Lyon, UJM-Saint-Étienne, CNRS, IOGS, LaHC UMR 5516, Saint-Étienne, France
2 IRIMAS - EA7499, Université de Haute-Alsace (UHA), Mulhouse Cedex, France
12H15-14H00 : DEJEUNER
SESSION SPECIALE - PROBLEMES OUVERTS EN IMAGERIE POUR LA BIOLOGIE
14H00-14H50 : CONFERENCE INVITEE
« Microscopie tomographique diffractive : principes, état de l'art, défis et perspectives pour l'imagerie biologique »
Olivier Haéberlé
IRIMAS - EA7499, Université de Haute-Alsace (UHA), Mulhouse Cedex, France
14H50-15H50 : PROBLEMES OUVERTS EN IMAGERIE POUR LA BIOLOGIE 1 - CHAIR : D. ROUSSEAU
« TIRF-RIM : Microscopie super-résolue en réflexion totale interne par éclairements aléatoires »
Kévin Affannoukoué1, Simon Labouesse2, Guillaume Maire1, Laurent Gallais1, Julien Savatier1, Claire Estibal4, Marc Allain1, Loïc Legoff1, Jérôme Idier3, Thomas Mangeat4, Anne Sentenac1
1 Institut Fresnel, CNRS, Aix-Marseille Université, Marseille, France
2 IBDM, Aix-Marseille Université, Marseille, France
3 LS2N, CNRS, Université de Nantes, Nantes, France
4 LITC Core Facility, Centre de Biologie Intégrative, Université de Toulouse, Toulouse, France
« Le Vasculoscope : un instrument basé sur le speckle dynamique polarisé pour l'imagerie d'un indice d'activité microvasculaire volumique »
Elise Colin1, Xavier Orlik2, Aurélien Plyer1
1 Onera-DTIS, Université Paris Saclay, Palaiseau Cedex, France
2 Onera-DOTA, 2 Av. Edouard Belin, Toulouse
« MA-TIRF IMAGE SUPER-RESOLUTION BY FLUOROPHORE FLUCTUATION ANALYSIS & INTENSITY ESTIMATION (3D-COL0RME) »
Vasiliki Stergiopoulou1, Luca Calatroni1, José Henrique de Morais Goulart2, Sébastien Schaub3, Laure Blanc-Féraud1
1 Université Côte d'Azur, CNRS, INRIA, I3S, Sophia Antipolis, France
2 IRIT, Université de Toulouse, Toulouse INP, Toulouse, France
3 Sorbonne Université, CNRS, LBDV, Villefranche-sur-Mer, France
15H50-16H05 : PAUSE
16H05-17H25 : PROBLEMES OUVERTS EN IMAGERIE POUR LA BIOLOGIE 2 - CHAIR : S. BRASSELET
« Mid-infrared spectral histopathology: application to the scoring of tumour aggressiveness of lung carcinomas »
Olivier Piot1,2, Vincent Vuiblet1,3, Valerie Untereiner2, Myriam Polette4, Ganesh Sockalingum1, Cyril Gobinet1
1 BioSpecT Unit, EA 7506, University of Reims Champagne-Ardenne, Reims, France.
2 Platform of Cellular and Tissular Imaging (PICT), University of Reims Champagne-Ardenne, Reims, France
3 Biopathology Laboratory, Reims University Hospital, Reims, France
4 INSERM UMR-S 1250, University of Reims Champagne-Ardenne, France
« Microscopie computationnelle hyperspectrale par feuillet de lumière structurée »
Sébastien Crombez1,2, Chloé Exbrayat-Heritier3, Florence Ruggiero3, Cédric Ray2, Nicolas Ducros1
1 Univ. Lyon, INSA-Lyon, UCB Lyon 1, UJM-St-Étienne, CREATIS CNRS, INSERM, Lyon, France
2 Univ. Lyon, UCB Lyon 1, CNRS, Institut Lumière Matière, Villeurbanne, France
3 Intitut de Génomique fonctionnelle, ENS-Lyon, UMR CNRS 5242, Univ. Lyon, Lyon Cedex, France
« Conjugaison de phase optique par analyseur de front d'onde à travers les milieux diffusants »
Tengfei Wu1, Baptiste Blochet1, Pascal Berto2, Marc Guillon1
1 Saints-Pères Paris Institute for the Neurosciences, CNRS UMR 8003, Université de Paris
2 Institut de la vision, Sorbonne Université
« Estimation of Fluorescence Contributions using Multiple-Wavelength Excitation: the example of PpIX for improving Glioma Classification »
Arthur Gautheron1,2, Michael Sdika1, Mathieu Hébert2, Bruno Montcel1
1 Univ. de Lyon, INSA - Lyon, Univ. Lyon 1, UJM Saint Etienne, CNRS, Inserm, CREATIS UMR 5220, LYON, France
2 Université de Lyon, Université Jean Monnet, IOGS, CNRS, UMR5516 LaHC, Saint Etienne, France
17H25-... : SESSION POSTERS
Cf. Liste des posters en fin de programme
Vendredi 18 mars
8H30-9H00 : ACCUEIL
09H00-09H50 : CONFERENCE INVITEE
« Intelligence Artificielle et imagerie cérébrale : impacts récents et enjeux à venir »
Christine Fernandez-Maloigne
Laboratoire I3M, laboratoire commun CNRS, SIEMENS, CHU et université de Poitiers
09H50-10H30 : DEEP LEARNING 1 - CHAIR : N. DUCROS
« Deep-Blur : identification et inversion aveugle d'opérateurs »
Pierre Weiss1, Valentin Debarnot2
1 Institut de Mathématiques de Toulouse, France
2 Département de maths et d'informatique, Université de Bâle, Suisse
« Estimation Locale de Flou de Défocalisation par Réseau de Neurones »
Rémy Leroy1, Pauline Trouvé-Peloux1, Frédéric Champagnat1, Bertrand Le Saux2
1 DTIS, ONERA - Université Paris-Saclay, Palaiseau, France
2 Phi-lab, ESA-ESRIN, Frascati, Italy
10H30-11H00 : PAUSE
11H00-12H00 : DEEP LEARNING 2 - CHAIR : C. FRINDEL
« Sélection de bandes hyperspectrales pour la prédiction non destructive des traits bio-chimiques des feuilles végétales »
Catherine Baskiotis, Josselin Aval, Marwa El Bouz, Ayman Al Falou
L@bisen, ISEN Yncréa Ouest, 20 rue Cuirassé Bretagne, 29 200 Brest, France
« Time-Lapse 3D d'embryons basé sur de la tomographie optique 3D sans mesure de phase intégrée dans un Framework de deep learning »
William Pierré1, Lionel Hervé1, Chiara Paviolo1, Ondrej Mandula1, Vincent Remondiere1, Sophie Morales1, Sergei Grudinin2, Pierre F Ray3, Magali Dhellemmes3, Christophe Arnoult3, Cédric Allier1
1 CEA - LETI/DTBS/LSIV, Grenoble, France
2 Univ. Grenoble Alpes, CNRS, Grenoble INP, LJK, Grenoble, France
3 Univ. Grenoble Alpes, INSERM U1209, CNRS UMR 5309, Institute for Advanced Biosciences, Team Genetics Epigenetics and Therapies of Infertility, Grenoble, France.
« Apport des réseaux profonds à extracteur complexe sur données de microscopie augmentée pour la détection du paludisme »
Houda Hassini1,2, Lyes Bouchama1,2, Arthur Baroni1, Bernadette Dorizzi1,Yaneck Gottesman1, Jacques Klossa2, Marc Thellier3
1 Telecom SudParis, 13 Place Marguerite Perey, Palaiseau, France
2 TRIBVN/T-life, 10Bis Rue des pavillons, Puteaux
3 Centre National de Référence du Paludisme de la Pitié Salpêtrière, Paris
12H00-14H00 : DEJEUNER
14H00-14H40 : IMAGERIE POLARIMETRIQUE - CHAIR : J. ZALLAT
« Microscopie de polarisation angulairement résolue pour l'étude des matériaux biréfringents par ptychographie de Fourier »
Arthur Baroni, Lyes Bouchama, Houda Hassini, Bernadette Dorizzi, Yaneck Gottesman
Institut Mine-Telecom, Télécom SudParis, Laboratoire Samovar, Palaiseau, France
« Stokes-Mueller polarimerty as a tool for histopatholagy assessment of ex vivo colon samples supported with machine learning »
Deyan Ivanov1, Viktor Dremin2,3, Tsanislava Genova4, Alexander Bykov5, Igor Meglinski3,5,6,Tatiana Novikova1,7 and Razvigor Ossikovski1
1 École polytechnique, IP Paris, CNRS, LPICM, Palaiseau, France
2 Research and Development Center of Biomedical Photonics, Orel State University, Orel, Russia
3 College of Engineering and Physical Sciences, Aston University, Birmingham, UK
4 Institute of Electronics, Bulgarian Academy of Sciences, Sofia, Bulgaria
5 Optoelectronics and Measurement Techniques Unit, University of Oulu, Finland
6 Institute of Clinical Medicine Sklifosovsky, Sechenov First Moscow State Medical University, Moscow, Russia
7 Department of Biomedical Engineering, Florida International University, Miami, FL, USA
14H40-15H20 : NOUVELLES MODALITES D'IMAGERIE - CHAIR : N. VERRIER
« Fourier-Transform Acousto-Optic imaging »
Maïmouna Bocoum1, Jean-Luc Gennisson2, Jean-Pierre Huignard1, Anne Louchet-Chauvet1, Quang Minh Thai1, François Ramaz1, Jean-Michel Tualle3
1 Institut Langevin, Ondes et Images - ESPCI Paris, PSL Research University, CNRS UMR 7587, Université Paris, Sorbonne Université, Paris, France
2 BIOMAPS, laboratoire d'imagerie biomédicale multi-modale à Paris-Saclay, Université Paris-Saclay, CNRS, INSERM, CEA, Orsay, France
3 Laboratoire de Physique des Lasers, CNRS, Université Paris 13, Sorbonne Paris Cité, Villetaneuse, France
« Microscope holographique infrarouge à résonance du plasmon de surface pour imagerie de phase »
Hongyu LI, Yoshitate TAKAKURA, Patrice TWARDOWSKI, et Jihad ZALLAT
Université de Strasbourg, ICube-UMR 7357 CNRS, Pôle API, Illkirch, France
15H20-15H35 : PAUSE
15H35-16H35 : NOUVELLES MODALITES D'IMAGERIE - CHAIR : M. BOFFETY
« Imagerie acousto-optique avec filtrage spectral ultra fin et persistant : Développements vers un test in vivo »
Quang Minh Thai1, Maïmouna Bocoum1, Johanne Seguin2, Nathalie Mignet2, François Ramaz1, Anne Louchet-Chauvet1
1 Institut Langevin, ESPCI Paris Tech, PSL Research University, 75005 Paris, France
2 University of Paris, INSERM, CNRS, UTCBS, Faculté de Pharmacie, 75005 Paris, France
« Non-invasive and Passive Measurement of an Optical Transmission Matrix Deep Inside a Scattering Medium » Ulysse Najar1, Victor Barolle1, Paul Balondrade1, Laura A. Cobus1, Kristina Irsch2, A. Claude Boccara1, Mathias Fink1, Alexandre Aubry1
1 Institut Langevin, ESPCI Paris, PSL University, CNRS, Paris, France
2 Vision Institute/Quinze-Vingts National Eye Hospital, Sorbonne University, CNRS, INSERM, Paris, France
« Tomographie par cohérence optique confocale à balayage de ligne (LC-OCT) et microspectroscopie Raman confocale co-localisées pour l'analyse morphologique et moléculaire de biop-sies de peau »
Léna Waszczuk1,2, Jonas Ogien2, Jean-Luc Perrot3, Arnaud Dubois1,2
1 Université Paris-Saclay, IOGS, Laboratoire Charles Fabry, Palaiseau, France
2 DAMAE Medical, Paris, France
3 Service de dermatologie, CHU de Saint- Étienne, Saint-Étienne, France
16H35 : FIN DES JIONC
LISTE DES POSTERS
01 - « Joint Demosaicing and Unmixing in Snapshot Spectral Images »
Kinan Abbas, Matthieu Puigt, Gilles Delmaire, and Gilles Roussel
Université du Littoral Côte d'Opale, LISIC - UR 4491, Calais, France
02 - « Vers une modélisation optique générique des signatures spectrales »
M. AL HAYEK1,2, J. AVAL1, M. ELBOUZ1, B. EL HASSAN2
1 L@bISEN, LSL Equipe, Yncréa Ouest, 29200 Brest, France
2 Laboratoire de Recherche en Télécommunications, Réseaux et Micro-ondes, Faculté de Génie, Tripoli, Liban
03 - « Compressed Super-Resolution Microscopy with Speckles »
Payvand Arjmand, Marc Guillon
Saints-Pères Paris Institute for the Neurosciences, Université de Paris, France
04 - « Apport de l'imagerie quantitative de phase pour décrire la structure 3D d'agrégats bactériens »
Renaud Gley1, Yankel Chekli2, Hélène Le Cordier1, Céline Caillet1, Christophe Beloin2, Jérôme F.L. Duval1, Isabelle Bihannic1
1 Laboratoire Interdisciplinaire des Environnements Continentaux, UMR 7360 CNRS - Université de Lorraine, Vandoeuvre lès Nancy, France
2 Institut Pasteur, Université de Paris, UMR CNRS6047, Unité de Génétique des Biofilms, Paris, France
05 - « Réalisation d'un analyseur de front d'onde multispectral monocoup »
Baptiste Blochet1, Tengfei Wu1, Pascal Berto2, Marc Guillon1
1 SPPIN, Université de Paris, CNRS UMR 8003, Paris, France
2 Institut de la vision, Sorbonne Université, Paris, France
06 - « Analyse de colonies bactérienne par microspectroscopie Brillouin »
Pierre Bouvet, Jean-Charles Baritaux
Univ. Grenoble Alpes, CEA, LETI, Grenoble, France
07 - « Autofocus numérique en microscopie holographique »
Dylan Brault1, Corinne Fournier1, Thomas Olivier1, Nicolas Faure2, Sophie Dixneuf3, Louis Thibon1, Loïc Denis1
1 Univ. Lyon, UJM-Saint-Etienne, CNRS, IOGS, LaHC UMR 5516, France
2 bioMerieux, Centre Christophe Mérieux, Grenoble, France
3 Bioassays, Microsystems & Optical Engineering Unit, BIOASTER, Lyon, France
08 - « Lagrangian Particle Tracking : un lien entre l'erreur de localisation et le taux de non détection »
Philippe Cornic1, Frédéric Champagnat1, Benjamin Leclaire2
1 ONERA - The French Aerospace Lab, Palaiseau, France
2 ONERA - The French Aerospace Lab, Meudon, France
09 - « Co-conception optique/réseau de neurones »
Marius Dufraisse1, Pauline Trouvé-Peloux1, Jean-Baptiste Volatier2, Frédéric Champagnat1
1 DTIS, ONERA - Université Paris-Saclay, Palaiseau, France
2 DOTA, ONERA - Université Paris-Saclay, Palaiseau, France
10 - « Etude de dispositions non coplanaires de miroirs freeform pour la gestion de contraintes opto-mécaniques »
Clément Freslier1, Louis Duveau1, Guillaume Druart1, Jean-Baptiste Volatier1, Thierry Lépine2
1 ONERA-The French Aerospace Lab, Palaiseau France
2 Univ Lyon, LaHC, CNRS UMR 5516, IOGS, Saint-Etienne, France
11 - « Evanescent field patterning for optogenetic activation of live cells »
Marc Grosjean1, Antoine Delon1, Irene Wang1, Olivier Destaing2, Alexei Grichine2, Mylène Pezet2
1 Laboratiore interdisciplinaire de physique (LiPhy),UGA, CNRS, France
2 Institut for advanced biosciences (IAB), UGA, CNRS, Incerm, France
12 - « Joint motion estimation and image reconstruction in respiratory-gated time-of-flight Positron Emission Tomography »
Frédéric Jolivet1, Ahmadreza Rezaei1, Georg Schramm1, Klaus Schäfers2, Michael Fieseler2, Fernando Boada3,4, Johan Nuyts1
1 Department of Imaging and Pathology, Division of Nuclear Medicine, KU Leuven, Belgium
2 European Institute for Molecular Imaging, University of Münster, Germany
3 Center for Advanced Imaging Innovation and Research, New York University, United States
4 Radiological Sciences Laboratory, Department of Radiology, Stanford University, United States
13 - « Classification et reconstruction de spectres à partir de mesures Raman comprimées »
Timothée Justel, Frédéric Galland, Antoine Roueff
Aix Marseille Univ, CNRS, Centrale Marseille, Institut Fresnel, Marseille, France
14 - « Noise-Correlation Elastography for Spatially Coherent and Incoherent ShearWave Sources »
Agathe Marmin1, Emmanuel Martins Seromenho1, Sybille Facca1, Stefan Catheline2, Amir Nahas1
1 ICube, UMR 7357 CNRS, University of Strasbourg, Strasbourg, France
2 LabTAU, Inserm U1032, Lyon, France
15 - « Dynamic structured illumination »
Guillaume Noetinger, Sébastien Popoff, Mathias Fink, Fabrice Lemoult
Institut Langevin, ESPCI Paris, Paris, France
16 - « Modulateurs à cristaux-liquides compensés pour des polarimètres stables en température »
Jean Rehbinder, Jean Dellinger, Briséis Varin, Marc Torzynski, Yoshitate Takakura, Christian Heinrich, Jihad Zallat
Laboratoire ICube, Université de Strasbourg, Bd Sébastien Brant, Illkirch, France
17 - « Off-axis full-field optical coherence tomography »
Emmanuel Martins Seromenho, Agathe Marmin, Amir Nahas
ICube Research Institute, CNRS - University of Strasbourg, Strasbourg, France
18 - « Mesures in-vivo de lésions cutanées par imagerie spectro-polarimétrique : Premiers résultats »
Briséis Varin1, Jean Rehbinder1, Jean Dellinger1, Christian Heinrich1, Bernard Cribier2, Cédric Lenormand2, Jihad Zallat1
1 Laboratoire ICube, Université de Strasbourg, Illkirch-Graffenstaden, France
2 Clinique Dermatologique, Faculté de médecine, Université de Strasbourg, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, France