50 years of KPN – Call for participation
The famous paper of Gilles Kahn on KPN, entitled « The semantics of a simple language...
Nous vous rappelons que, afin de garantir l'accès de tous les inscrits aux salles de réunion, l'inscription aux réunions est gratuite mais obligatoire.
48 personnes membres du GdR ISIS, et 61 personnes non membres du GdR, sont inscrits à cette réunion.
Capacité de la salle : 150 personnes.
La 14e édition des « Journées Imagerie Optique Non-Conventionnelle » (JIONC) se tiendra cette année dans les locaux de l'Institut Langevin, Paris 5e, les 18 et 19 mars 2019.
À l'interface de l'optique et du traitement du signal/image, ces rencontres visent à réunir les acteurs nationaux (chercheurs, ingénieurs, académiques ou industriels) de ces différents domaines, afin d'échanger sur les plus récents développements de systèmes ou de traitements pour l'imagerie non-conventionnelle et d'évaluer leurs applications potentielles.
Cette année, nous accueillerons deux présentations invitées données par :
Programme des JIONC 2019.
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Lundi 18 mars
9H30-10H00 : Accueil + Introduction des JIONC 2019
10H00-10H50 : Conférence invitée
Joseph Angelo, Enagnon Aguenounon, Manon Schmidt, Swapnesh Panigrahi, Foudil Dadouche, Wilfried Uhring, Murielle Torregrossa, Sylvain Gioux
Laboratoire ICube, UDS-CNRS, UMR 7357, Strasbourg
Résumé en fin de programme
10H50-11H50 : Imagerie pour l'ophtalmologie
Pedro Mece1, Kate Grieve2, Michel Paques2, Serge Meimon3, Claude Boccara1
1Institut Langevin, ESPCI Paris, Université PSL, Paris, France
2Hôpital des Quinze-Vingts, Institut de la Vision, Paris, France
3ONERA, the French Aerospace Lab, Chatillon, France
Léo Puyo1, Michel Paques2,3, Mathias Fink1, José-Alain Sahel2,3, Michael Atlan1
1Institut Langevin, CNRS, PSL Research University, ESPCI Paris, Paris. France
2Institut de la Vision, 17 rue Moreau, Paris. France
3Centre d'investigation clinique des Quinze-Vingts. INSERM, Paris. France
Antoine Chen1,2,5, Cyril Petit1,5, David Pureur2, Michel Paques3,4,5, Serge Meimon1,5
1DOTA, ONERA, Université Paris Saclay, Palaiseau, France
2Quantel Medical, Cournon d'Auvergne, France
3CIC 1423, INSERM, CHNO des Quinze-Vingts, Paris, France
4Institut de la Vision, Sorbonne Université, INSERM, CNRS, Paris, France
5PARIS group - Paris Adaptive-optics for Retinal Imaging and Surgery
11H50-14H00 : Déjeuner
14H00-15H20 : Algorithmes et traitements d'image
Cecilia Tarpau1,2,3, Maï K. Nguyen1
1Equipes de Traitement de l'Information et Systèmes, ENSEA / UCP / CNRS UMR 8051, Cergy Pontoise, France
2Laboratoire de Physique Théorique et Modélisation, UCP / CNRS UMR 8051, Cergy Pontoise, France
3Laboratoire de Mathématiques de Versailles, UVSQ / CNRS UMR 8100, Versailles, France
Julien Flamant, Sebastian Miron, David Brie
Université de Lorraine, CNRS, CRAN, Nancy, France
Jean-François Giovannelli, Cornelia Vacar
Laboratoire IMS, Univ. Bordeaux, CNRS, BINP, France
Yunshi Huang1, Émilie Chouzenoux1, Victor Elvira2
1CVN, INRIA Saclay, CentraleSupélec, France
2IMT Lille Douai & CRIStA, UMR CNRS 9189, Villeneuve d'Ascq, France
15H20-15H50 : Pause Café
15H50-16H30 : Simulation et analyse d'images
Sylvie Lelandais1, Christophe Montagne1, Justin Plantier1,2
1IBISC, Univ Evry, Université Paris Saclay, Evry, France
2Département NSCo, IRBA, Brétigny sur Orge Cedex, France
Alix de Gouvello, Laurent Soulier, Antoine Dupret
CEA, LIST, Nano-INNOV, Gif-sur-Yvette, France
16H30-17H10 : Contrôle qualité optique pour l'industrie
Benjamin Bringier1,2, Bruno Mercier1,2, Majdi Khoudeir1,2
1CNRS, XLIM, UMR 7252, Limoges, France
2Univ. Poitiers, XLIM, Poitiers, France
A. Zanzouri Kechiche1, O. Aubreton1, A. Mathieu2, C. Stolz1
1Laboratoire ERL VIBOT CNRS, ImViA, Univ. de Bourgogne Franche-Comté, Le Creusot, France
2Laboratoire ICB, département IRM, équipe Ltm, Université de Bourgogne Franche-Comté, Le Creusot, France
17H10-... : Session Posters
Cf. Liste des posters en fin de programme
Mardi 19 mars
09H00-09H50 : Conférence invitée
Anne Sentenac1, Thomas Mangeat2, Jérôme Idier3
1CNRS, Institut Fresnel, Marseille, France
2LBCMCP, Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université de Toulouse, CNRS, Toulouse, France
3Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes, École Centrale de Nantes, CNRS, Nantes, France
Résumé en fin de programme
09H50-10H30 : Super-résolution
Paul C. Montgomery, Stéphane Perrin et Sylvain Lecler
Lab. des Sciences de l'Ingénieur, de l'Informatique et de l'Imagerie (ICube), UDS-CNRS, Strasbourg, France
Yann Lai-Tim1,2, Laurent Mugnier1, François Orieux3, Roberto Baena-Gallé1, Michel Paques2, Serge Meimon1
1DOTA, ONERA, Université Paris Saclay, F-91123 Palaiseau, France
2CIC 1423, INSERM, Quinze-Vingts Hospital, Paris, France
3Lab. des Signaux et Systèmes (Univ. Paris-Sud, CNRS, CentraleSupélec, Univ Paris-Saclay), Gif sur Yvette
10H30-11H00 : Pause Cafe
11H00-12H00 : Problèmes inverses
Anthony Berdeu1, Éric Thiébaut2, Ferréol Soulez2, Loïc Denis1, Maud Langlois2
1Université de Lyon, UJM-St-Etienne, CNRS, Institut d'Optique, Laboratoire Hubert Curien, Saint-Etienne, France
2Université de Lyon, ENS de Lyon, CNRS, Centre de Recherche Astrophysique de Lyon, St-Genis-Laval, France
Alexandre Duhant1,2, Meriam Triki2, Olivier Strauss1
1ICAR team, LIRMM, University of Montpellier, CNRS, Montpellier, France
2Department of Research and Development, T-Waves Technologies, Montpellier, France
Olivier Herscovici-Schiller1, Frédéric Cassaing2, Pierre-Emmanuel Haensler1, Laurent Mugnier2, Baptiste Levasseur1, Sébastien Reynaud1
1DTIS, ONERA, Université Paris-Saclay, Palaiseau, France
2DOTA, ONERA, Université Paris-Saclay, Châtillon, France
12H00-14H00 : Déjeuner
14H00-15H20 : Microscopies
Yan Feng1, Zhengkun Liu2, Antonio Ortiz1, Yuewei Liu3, Nadine Peyriéras1, Xiaohong Fang4
1Laboratory BioEmergences (USR3695), CNRS, University Paris-Saclay, Gif-sur-Yvette, France
2National Synchrotron Radiation Lab., Univ. of Science and Technology of China, Anhui, China
3Inst. of Statistics & Probability, School of Mathematics & Statistics, Lanzhou Univ., Gansu, China
4Beijing National Laboratory for Molecular Sciences, Key Laboratory of Molecular Nanostructure and Nanotechnology, Institute of Chemistry, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China
Antoine Hubert1,2, Fabrice Harms1, Rémy Juvenal1, Vincent Loriette2, Cynthia Veilly1, Guillaume Dovillaire1, Xavier Levecq1, Georges Farkouh3, Laurent Bourdieu4, François Rouyer3, Alexandra Fragola2
1Imagine Optic, 18 rue Charles de Gaulle, Orsay, France
2LPEM - ESPCI, 10 rue Vauquelin, Paris, France
3Institut des Neurosciences Paris-Saclay, Gif-Sur-Yvette, France
4Institut de Biologie de l'Ecole Normale Supérieure, Paris, France
Ludovic Foucault1, Nicolas Verrier1, Matthieu Debailleul1, Bertrand Simon2, Olivier Haeberlé1
1IRIMAS EA7499, Université de Haute-Alsace, Mulhouse, France
2LP2N, CNRS UMR 5298, Université de Bordeaux, Institut d'Optique Graduate School, Talence, France
T. S. H. Yoo1, A. Fernández2, F. Moreno2, J. M. Saiz2, R. Ossikovski1, E. Garcia-Caurel1
1LPICM, CNRS, Ecole polytechnique, Université Paris-Saclay, Palaiseau, France
2Dpto. de Física Aplicada, Universidad de Cantabria, Santander, Espagne
15H20-15H40 : Pause
15H40-16H40 : Nouvelles modalités d'imagerie non conventionnelle
Swapnesh Panigrahi1, Julien Fade1, Romain Agaisse1, Hema Ramachandran2, Mehdi Alouini1
1Univ Rennes, CNRS, Institut FOTON, 263 av. Général Leclerc, 35 042 Rennes, France
2Raman Research Institute, Sadashiv Nagar, Bangalore, Inde
R. Demur1,2, A. Grisard1, Eric Lallier1, Luc Leviandier1, Loïc Morvan1, Nicolas Treps2, Claude Fabre2
1Thales Research & Technology, Palaiseau, France
2Laboratoire Kastler Brossel, Sorbonne Université, CNRS, ENS-University PSL, Collège de France, Paris, France
F.A. Banville1,2, Z. Khadir1,2, J. Moreau1, M. Besbes1, C. Collin1,2, M. Canva1,2, P. G. Charette1
1Laboratoire Charles Fabry, Institut d'Optique Graduate School, Université Paris-Saclay, France
2Laboratoire Nanotechnologies Nanosystèmes, CNRS-Université de Sherbrooke, Canada
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LISTE DES POSTERS
01 - « Augmentation de données polarimétriques respectant les propriétés physiques de la scène capturée »
Marc Blanchon, Olivier Morel, Désiré Sidibé
VIBOT ERL CNRS 6000, ImViA, Université de Bourgogne Franche Comte, Le Creusot, France
02 - « Reconstruction d'hologramme off-axis acquis sur un dispositif common path »
Dylan Brault1,2, Thibaud Mourlon2, Corinne Fournier1, Thomas Olivier1, Arun Anand3
1Université Lyon, UJM St-Etienne, CNRS, Institut d'Optique, Laboratoire Hubert Curien, St-Etienne, France.
2Télécom Saint-Etienne, Saint-Etienne, France.
3Optics Laboratory, Applied Physics Department, Faculty of Technology & Engineering, Univ. of Baroda, India.
03 - « Conception conjointe d'une caméra 3D par illumination structurée pour l'inspection de surface »
Benjamin Buat, Pauline Trouvé-Peloux, Guy Le Besnerais, Frédéric Champagnat
DTIS, ONERA, Université Paris-Saclay, FR-91123 Palaiseau, France
04 - « Études de nouvelles architectures de spectro-imageurs compacts pour les sciences de l'atmosphère »
Nathan Cariou1, 2, Florence de la Barrière1, Yann Ferrec1, Nicolas Guerineau1
1ONERA, Palaiseau, France
2CNES, Toulouse, France
05 - « Imagerie hyperspectrale compressive de la Protoporphyrine IX »
Leticia Lambert Angulo, Bruno Montcel, Nicolas Ducros
Univ Lyon, INSA-Lyon, UCB Lyon 1, CNRS, Inserm, CREATIS UMR 5220, U1206, Villeurbanne, France
06 - « Apport des optiques freeform pour l'imagerie multispectrale »
Louis Duveau1, 2 Thierry Lépine3, Emmanuel Hugot4, Guillaume Druart1
1ONERA, Palaiseau, France
2DGA, Paris, France
3Laboratoire Hubert Curien, Saint-Etienne, France
4Laboratoire d'Astrophysique de Marseille, Marseille, France
07 - « Effets statistiques du ré-échantillonnage sur le speckle pleinement développé en imagerie cohérente laser et radar »
Simon Erdmann1, Élise Koeniguer2, Xavier Orlik1, Flora Weissgerber3
1ONERA, Département Optique et Techniques Associées, Toulouse, France
2ONERA, Département Traitement de l'Information et Systèmes, Palaiseau, France
3ONERA, Département ÉlectroMagnétisme et Radar, Palaiseau, France
08 - « Généralisation de motifs éxacte en imagerie mono-pixel »
Antonio Lorente Mur1, Jérémy Cohen2, Nicolas Ducros1
1Univ Lyon, INSA-Lyon, UCB Lyon 1, CNRS, Inserm, CREATIS UMR 5220, U1206, Villeurbanne
2Univ Rennes, Inria, CNRS, IRISA, Rennes, France
09 - « Haute résolution optique pour les spécimens non marqués »
Fabien Momey1, Nicolas Verrier2, Marc Ruff3, Corinne Fournier1, Olivier Haeberlé2
1Université de Lyon, UJM-St-Étienne, CNRS, Institut d'Optique, Lab. Hubert Curien UMR 5516, St-Étienne, France
2IRIMAS, Université de Haute-Alsace, Mulhouse, France
3Univ de Strasbourg, CNRS, INSERM, Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire, Illkirch, France.
10 - « Micro endoscopie non linéaire pour le diagnostic optique en cancérologie »
Nathalie Westbrook1, Alexandra Fragola2, Christophe Hecquet1, Vincent Loriette2, Thomas Pons2, Geneviève Bourg-Heckly3, Christine Vever-Bizet3, Sergei Kruglik3, Frédéric Louradour4
1Laboratoire Charles Fabry, Institut d'Optique, CNRS, Université Paris-Saclay, Palaiseau, France
2LPEM, ESPCI, Paris, France
3Laboratoire Jean Perrin, Sorbonne Université, Paris, France
4XLIM, UMR-CNRS 7252, Université de Limoges, France
RESUMÉS DES CONFÉRENCES INVITÉES
« Imagerie dans le Domaine Fréquentiel Spatial: Vers l'imagerie multispectrale quantitative et temps-réel pour la chirurgie »
Laboratoire ICube, UDS-CNRS, UMR 7357, Strasbourg
Il existe un besoin clinique pressant de fournir des outils pour un guidage objectif du geste chirurgical. Actuellement, l'évaluation des tissus devant être réséqués ou évités est effectuée subjectivement, entrainant un grand nombre d'échecs coûteux tant pour les patients que pour le système de santé. Parce que la lumière proche infrarouge (NIR) se propage profondément dans les tissus vivants et interagit avec les constituants moléculaires, elle offre des capacités inégalées pour l'identification objective de tissus sains et malsains pendant une procédure chirurgicale. Ces capacités sont bien illustrées par le succès de la translation clinique de l'imagerie par fluorescence en chirurgie vasculaire et oncologique. Au cours de cette présentation, nous allons passer en revue nos efforts pour fournir des images quantitatives, large champ et en temps réel pendant la chirurgie utilisant l'imagerie optique diffuse NIR. Nous présenterons en particulier nos contributions relatives au développement d'une nouvelle méthode d'imagerie dans le domaine fréquentiel spatial (SFDI) et décrirons nos travaux récents sur l'imagerie multispectrale quantitative temps réel pour des interventions chirurgicales.
« Super-resolution in fluorescence microscopy using unknown speckles : the Random Illumination Microscopy approach »
1CNRS, Institut Fresnel, Marseille, France
2LBCMCP, Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université de Toulouse, CNRS, Toulouse, France
3Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes, École Centrale de Nantes, CNRS, Nantes, France
The microscopy technique presenting the best compromise between resolution and practical application to live samples is Structured Illumination Microscopy (SIM). This approach consists in forming a super-resolved image of the sample by processing numerically several low-resolution images obtained for different positions and orientations of a known illumination pattern. Scanning microscopy with or without pixel reassignment (Zeiss Airyscan), which uses a focused spot as excitation pattern, and periodic SIM (Zeiss Elyra), which uses a light grid, are the two main examples of SIM. The resolution of periodic-SIM can reach 100 nm transversally and 300 nm axially for the best apparatus (the scanning SIM being less performing) [Shao_2011]. Yet, this achievement requires a precise knowledge of the illumination patterns. If the latter is deformed by the optical system or the sample itself, the numerical process leading to the super-resolved image fails. As a consequence, the experimental implementation of SIM is very technical [Demmerle_2017] and its application domain is limited to non-distorting, weakly scattering samples. In particular, the resolution of SIM quickly deteriorates when imaging specific cells inside a biological tissue because the illumination is modified by the inhomogeneous environment. Now, this configuration is encountered in most in situ biological studies.
In the last years, our consortium has proposed a novel SIM configuration that is insensitive to the illumination deformation, Random Illumination Microscopy (RIM) [Mudry_2012]. It consists in illuminating the sample with different realizations of (uncontrolled) speckles and reconstructing a super-resolved image from the stack of data using the statistical properties of the illumination [Mudry_2012, Negash_2016, Labouesse_2017].The latter being insensitive to scattering and aberration, RIM can succeed in configurations where classical SIM fails. In addition, it is much simpler to implement experimentally as it avoids the control of the illumination.
A mathematical analysis demonstrated that a two-fold resolution gain, similar to that of classical SIM, could be obtained with RIM [Idier_2018]. Preliminary experimental results confirmed that RIM competes with periodic-SIM in terms of spatial resolution with a temporal resolution and toxicity compatible with long term live imaging.
References :
Shao et al, Nature Methods 8, 1044-1046 (2011)
Demmerle et al, Nature Protocol, 12, 988-1010 (2017)
Mudry et al, Nature Photonics, 6, 312-315 (2012)
Negash et al, J. Opt. Soc. Am. A, 33, 1089-1093 (2016)
Labouesse et al, IEEE transactions on image processing, 26, 2480-2483 (2017)
Idier et al, IEEE Comp. Imaging, 4, 87 (2018)