Description du projet de stage :
Ce stage s’inscrit dans le cadre d’un protocole de recherche clinique du CHU de Reims dont l’objectif est de comprendre les mécanismes de croissance des anévrismes intracrâniens non rompus en croisant les données des IRMs morphologiques et des IRMs de flux 4D. Le stage pourra éventuellement être prolongé par une thèse de doctorat sur la même thématique.
Missions du stage :
- Développer une méthode de suivi longitudinal des anévrismes à partir d’IRM successives (segmentation, recalage, mesures morphologiques) (Fig 1).
- Détecter les zones de croissance morphologique locale (Méthode Local Dissimilarity Map).
- Extraire et analyser des paramètres hémodynamiques (Fig 2).
- Contribuer au développement du logiciel MRProject (logiciel propriétaire basé sur des bibliothèques open-source) pour la visualisation interactive 2D/3D/4D et l’intégration de marqueurs hémodynamiques.
(Programmation scientifique en C++ et utilisation de bibliothèques d’analyse d’image (ITK, VTK)
Logiciels utilisés :
Microsoft Visual Studio, QT, ITK, VTK, OpenGL, Eigen, GIT, CMAKE, Doxygen…
Profil recherché :
Master II ou école d’ingénieur en Informatique / Mathématiques appliquées
- Curiosité scientifique médicale avec intérêt pour la recherche
- Connaissances en programmation C++ (ITK, VTK, QT)
- Connaissances en statistique et analyse de données (R)
- Connaissances en traitement d’images
- Notion en imagerie médicale (IRM, Dicom)
- Maitrise de l’anglais
- Autonomie, esprit d’initiative
Encadrement :
Christophe PORTEFAIX – Ingénieur de Recherche – Tel : 03.26.78.94.82 – Email : cportefaix@chu-reims.fr
Esther FONTAINE – Doctorante en mathématiques appliquées – Email : esther.fontaine@univ-reims.fr
Lieu du stage : Le stagiaire sera basé au CHU de Reims
Durée du stage : 6 mois
