Collecte et analyse d'une base de données multimodale de peau

27 Septembre 2024

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Catégorie : Stagiaire

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Lieu : Dijon - France

Durée : 6 mois (négociable)

Date de début : de janvier 2025 à mars 2025

 

Superviseur :

Yannick Benezeth (Professeur, IMVIA)

Description du projet :

Les plaies chroniques représentent un défi majeur pour les systèmes de santé du monde entier. Leur suivi est crucial pour optimiser le traitement et améliorer les résultats pour les patients. Le projet ANR Wound-rPPG vise à développer une nouvelle méthode non invasive de suivi de la cicatrisation des plaies.

Dans le cadre de ce stage, nous prévoyons de collecter une base de données multimodale de tissus cutanés et d'employer des techniques avancées pour estimer la perfusion microvasculaire sur ces données collectées.

Le processus de collecte de données comprendra une série de tâches, en commençant par le recrutement des participants et l'établissement d'un protocole d'acquisition de données. Des séquences vidéo multispectrales de tissus de peau seront capturées à différentes bandes spectrales, suivies de mesures spectroscopiques ponctuelles pour obtenir des spectres de réflectance diffuse. Ces spectres seront recalés avec les données vidéo multispectrales, tandis qu'un appareil d'échographie portable mesurera l'épaisseur des couches de peau et les emplacements des principales artères.

Enfin, les estimations de la perfusion microvasculaire seront validées à l'aide d'algorithmes existants développés au laboratoire (e.g., [Kam11, Ham22]).

[Kam11] Kamshilin et al., "Photoplethysmographic imaging of high spatial resolution, " Biomed. Opt. Express, 2011.

[Ham22] Hammer et al., Camera-based assessment of cutaneous perfusion strength in a clinical setting, Physiological Measurement, 2022.

Responsabilités :

• Acquisition de séquences vidéo multispectrales de tissus cutanés à l'aide d'un système d'acquisition multispectrale développé sur mesure.
• Participer à la collecte de mesures anatomiques et optiques (par exemple, épaisseur de la couche cutanée et spectres de réflectance).
• Évaluation d'algorithmes existants pour l'estimation de la perfusion microvasculaire.

Profil :

• Actuellement en Master en génie biomédical, informatique, vision par ordinateur ou dans un domaine connexe.
• Fort intérêt pour l'imagerie médicale, la vision et les expérimentations.
• Compréhension de base des techniques optiques, telles que la spectroscopie.
• Expérience en analyse de données et langages de programmation (par exemple, MATLAB, Python).
• Possibilité de prolonger le stage en une thèse de doctorat.

Pour postuler :

Les candidats intéressés sont invités à soumettre leur candidature, comprenant un CV, une lettre de motivation et un relevé de notes récent à :

Yannick Benezeth : yannick.benezeth@u-bourgogne.fr