Description du projet de stage :
L’objectif du projet consiste à développer et optimiser un logiciel existant (Fig. 2) de visualisation d’images médicales utilisant des versions de bibliothèques récentes (VTK/ITK, …). Ce stage s’inscrit dans le cadre d’un protocole de recherche clinique du CHU de Reims dont l’objectif est de comprendre les mécanismes de croissance des anévrismes intracrâniens non rompus en croisant les données des IRMs morphologiques et des IRMs de flux 4D. L’objectif est de développer un logiciel convivial utilisable par les médecins pour l’aide au diagnostic de la croissance des anévrismes.
Missions du stage :
- Contribuer au développement du logiciel MRProject (logiciel propriétaire basé sur des bibliothèques open-source) pour la visualisation interactive 2D/3D/4D et l’intégration de marqueurs hémodynamiques.
(Programmation scientifique en C++ et utilisation de bibliothèques d’analyse d’image (ITK, VTK) - Développer une méthode de suivi longitudinal des anévrismes à partir d’IRM successives (segmentation, recalage, mesures morphologiques) (Fig 1).
- Détecter les zones de croissance morphologique locale (Méthode Local Dissimilarity Map).
- Extraire et analyser des paramètres hémodynamiques (Fig 2)
Logiciels utilisés :
Microsoft Visual Studio, QT, ITK, VTK, OpenGL, Eigen, GIT, CMAKE, Doxygen…
Profil recherché :
Master II ou école d’ingénieur en Informatique
- Maitrise en programmation C++ (ITK, VTK, QT)
- Curiosité scientifique médicale avec intérêt pour la recherche
- Connaissances en statistique et analyse de données (R)
- Connaissances en traitement d’images
- Notion en imagerie médicale (IRM, Dicom)
- Maitrise de l’anglais
- Autonomie, esprit d’initiative
Encadrement :
Christophe PORTEFAIX – Ingénieur de Recherche – Tel : 03.26.78.94.82 – Email : cportefaix@chu-reims.fr
Esther FONTAINE – Doctorante en mathématiques appliquées – Email : esther.fontaine@univ-reims.fr
Lieu du stage : Le stagiaire sera basé au CHU de Reims
Durée du stage : 6 mois
